home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00372 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.3 KB  |  31 lines
  1. **********************
  2. * Profilin signature *
  3. **********************
  4.  
  5. Profilin [1,2] is a small  eukaryotic  protein that  binds  to monomeric actin
  6. (G-actin) in a 1:1 ratio  thus  preventing  the  polymerization  of actin into
  7. filaments (F-actin).
  8.  
  9. Overall sequence  similarity  among  profilin from  organisms  which belong to
  10. different phyla (ranging  from fungi to mammals) is low,  but  the  N-terminal
  11. region is relatively well  conserved. That region is thought to be involved in
  12. the binding to actin. The signature pattern for profilin is based on conserved
  13. residues at the N-terminal extremity.
  14.  
  15. Recently [3], a protein structurally similar to  profilin has been found to be
  16. present in the vaccinia virus genome (ORF A42).
  17.  
  18. -Consensus pattern: <x(0,1)-[STA]-x(0,1)-W-[DENQH]-x-[YI]-x-[DEQ]
  19. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  20. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: bacteriocin  lactococcin G,   alpha
  21.  subunit.
  22. -Last update: June 1994 / Text revised.
  23.  
  24. [ 1] Haarer B.K., Brown S.S.
  25.      Cell Motil. Cytoskeleton 17:71-74(1990).
  26. [ 2] Takagi T., Mabuchi I., Hosoya H., Furuhashi K., Hatano S.
  27.      Eur. J. Biochem. 192:777-781(1990).
  28. [ 3] Goebel S.J., Johnson G.P., Perkus M.E., Davis S.W., Winslow J.P.,
  29.      Paoletti E.
  30.      Virology 179:247-266(1990).
  31.